シーズン2 第13話 「反撃開始!」
ついにマイケルとリンカーンを追い詰めたマホーンだが、国境警備隊に囲まれ、二人を殺害することが出来なかった。
飛行機を追跡されたスクレは、一か八かパラシュートで飛び降りる。ティーバッグはようやく探していた人物の家を見つけ、マイケルが逮捕されたと知ったサラは、人知れずどこかに姿を消す。殺人罪で服役することになったベリックは、フォックスリバー刑務所に収監された。
マイケルとリンカーンを殺さないと妻子を殺すとキムに脅されるマホーン。しかし、他の警官たちのいる前で手は出せず、フォックスリバー刑務所への移送途中で殺すしか方法は無かった。一方、存在を消され窮地に立たされたケラーマンは、二人を始末する代わりに復職させるようキムに迫る。
移送途中、事故のためトンネル内で立往生してしまう護送車。様子を見に警官たちが護送車を降りると、わざとらしく手錠のカギが落ちていた。マホーンの罠と知りつつも脱走し、トンネルの非常口から逃げ出す二人。しかし、あと一歩で外に出られるという時、やはりマホーンとケラーマンに挟み撃ちにされてしまう…。